一. 作者
使徒保羅在本信中指出他自己就是作者，這是他一貫的作風，也是當代書信的格式。他說他寫這信時因為見證耶穌基督而被囚監中（9、10、13、23節）。
二. 寫作時地
我們很難確定保羅寫這信時正在甚麼地方被囚。在該撒利亞、以弗所和羅馬三個有可能的地方中，以弗所和羅馬，似乎跟本書及（與本書關係極密切的）歌羅西書的資料（西4:7-14；參門23、24）吻合。保羅在信中說馬可和路加是他的同伴，則又支持了羅馬是本書寫作地點的說法（第24節）。然而，以弗所跟腓利門在歌羅西的住所十分相近（約100哩），加上保羅宣佈他將要探望歌羅西（第22節），則又支持以弗所是被囚之地的看法。雖然使徒行傳沒有明確地提到保羅曾在以弗所被囚，但保羅的宣教隊在該城傳道的記載，清楚指出他曾遇到頗為激烈的反對（徒20:19），保羅自己描述那時的情況所用的語氣暗示他曾被捕下監（林前15:32；林後1:8-10）。此書寫作時間約為主後61年。
三. 收信人
本書常被看為保羅寫給腓利門(「有益」之意)的私人信件，腓利門是被保羅引領悔改的信徒和朋友，也是歌羅西教會的領袖和奴隸主。事實上，這信是寄給腓利門、亞腓亞（大概是腓利門的妻子）、亞基布，以及在腓利門家中聚集的眾信徒的（1、2節）。信中的問候是來自以巴弗、馬可、亞里達古、底馬和路加，這些人代表了一群使人刮目相看的教會領袖（23、24節），保羅提及他們的目的是叫腓利門知道，他對所求的事之回應，並不是一個私人的決定，而是要向所屬信徒群體交待的一個決定。在基督的身體裏，關乎信徒關係的事情，是整個群體所關注的，這類事情不可看為私人的問題，因為事情會影響整個教會（太19:15-20）。
信中清楚顯示保羅和腓利門之間有一份溫暖的弟兄之愛維繫著，保羅稱腓利門為他「親愛的同工」（第1節）；他以感情橫溢的言詞讚賞腓利門參與傳道的事工（5-7節）；他基於愛向腓利門求情（第9節）；他提起他們兩人是同伴（第17節）；他溫婉地提醒腓利門他也在救恩上虧欠保羅（第19節），並相信他會按保羅的要求，甚至過於所求地去行事。
四. 處境
保羅寫這信的緣由涉及第三者──阿尼西母，一名從腓利門那裏逃走了的奴隸。這奴隸在主人家裏做了一些信中沒有明言的錯事後，便逃走了。他逃到一個大城市，便企圖在不同種族的人中隱姓埋名；當時任何大都市都有一群由不同種族雜處的低下階層。透過神的安排（但實際情況仍是一個謎），這逃脫了的奴隸受到保羅的影響，悔改歸了主（第10節）；並受保羅鍾愛，成為保羅心上的人（第12節）；他參與了保羅的福音工作，以致保羅有意把他留下侍侯，作他「親愛忠心的弟兄」（第13節；西4:9）。
保羅知道，若他把阿尼西母留下作同工，腓利門也會勉強同意他的決定（13、14節
）。然而，保羅決定利用這不明確的處境來使腓利門思想，如何把他所信的應用在奴隸制度上，令他釋放阿尼西母，並把阿尼西母提升至弟兄的位置；不單在屬靈的意義上（「按主說」），在社會的地位上也是如此（「屬肉體說」，第16節）。腓利門保存了這信，證明他已答應保羅的要求，讓阿尼西母重獲自由，若腓利門拒絕這要求，他應已把信毀滅，免得人以這信為證據，控告他不順從保羅。
這故事還有一個有趣的後記：在伊格那丟寫給以弗所人的書信中，一位名阿尼西母的老監督一再被提及，這老監督是在二世紀早期帶領以弗所教會的。學者認為這位監督跟腓利門的奴隸是同一人，因為伊格那丟在信中，也使用了保羅在腓利門書11和20兩 節中，有關阿尼西母一名的雙關語（阿尼西母的名意是「有用」或「有益處」）。若確實是這樣，可能這先前作奴隸的人，就是收集保羅的書信的人；這些書信後來被列人了新約的正典中，包括了腓利門書。
五. 寫作目的
保羅這書信的目的是戲劇化地表達奴隸制度與基督教的不協調，因而爭取釋放阿尼西母。信中沒有顯示保羅曾擔心腓利門會根據羅馬法律，對這名逃走了的奴隸施以嚴厲的處分。然而，保羅所關心的卻是腓利門是否不再待他如奴隸，而是接納他如腓利門家中正式的成員並給他尊嚴，至少像他尊重保羅那樣（17、21節）。
六. 教導
這短短的書信裏面藏有很豐富的教訓，其中值得在此一提的有三項。
1.
本書見證了福音給社會中充滿罪的制度，帶來革命性的挑戰，因此，這書包含了對奴隸制度的指斥。耶穌不許祂的跟從者佔有或控制另一個人，在基督教的群體裏，身為主人或領袖的，要藉著服侍人來完成他的任務，他要從社會上最低下階層的人做起，而不是按著一般分權的觀念，站在權力的頂峰（可10:42-45）。如此基督徒中間是沒有階級之分的，在基督裏，並沒有奴隸和自由人之分，因為在祂裏面，所有人都已合為一體（加3:28）。作奴隸的基督徒若有機會得自由，就要好好利用那機會（林前7:21）；那些本是自由的人，就要小心避免成為人的奴僕（林前10:23；加5:1）。相反地，基督徒的奴隸主，要作他眾奴隸的僕人（弗6:9上），所有基督徒都要作奴僕，彼此服侍（加5:13）。這樣，腓利門就要接納阿尼西母，並且看他「不再是奴僕」了（第16節）。
2.
人若連於福音，就不可故步自封，也不能激烈地推翻現狀，福音的革命性是以作僕人的姿態表達，而不是用武力去達至。保羅建議阿尼西母以順服地返回腓利門家中來表明這解放神學，容讓聖靈把他們兩人的關係作徹底的改變。用撒但的方法來製造天國，只會摒除神的干預，並帶來變本加厲的壓迫。
3. 本書提供了一個屬靈的聖職人員的極佳模範。腓利門和阿尼西母當時的處境需要有一個和解者在他們中間，這人必須受腓利門尊重，才能有效地為阿尼西母說話。保羅使用了一些心理戰術來取勝，他先對腓利門加以讚賞（4-7節）；其後又強調自己為福音的緣故也寧願犧牲（第9節）；他利用腓利門行善的心意（第14節）；又以個人的友誼來求情（17、20節）；他主動承擔責任，補償腓利門所蒙受的損失（第18節）；他提醒腓利門，指出他對保羅也有虧欠（第19節），並聲明將會與他見面，那麼，腓利門若拒絕這要求，便可能會在見面時感到尷尬（第22節）。保羅利用了個人的關係以及牧者的身分，他的態度是友善的，但也是志在必得的。這正好展示了堅決和婉轉兩者的平衡；也示範了真正的基督徒領袖，應如何透過游說和懇求，而不是靠高壓和權威來完成任務。
雖然腓利門書是聖經中最短的文件之一，卻可作為永久的記錄，銘記著基督賜給所有人尊嚴和平等，不分階層、性別、地位或身分。這書也賜給基督徒一個命令和方法，來尋求有效的社會改革。
七. 本書大綱
1. 問安（1-3）
2. 稱讚腓利門（4-7）
3. 為阿尼西母求情（8-17）
4. 保羅的保證 (18-19)
5. 保羅的盼望 (20-21)
6. 保羅的交代（22）
5. 問安祝頌（23-25）
